ロックマン エグゼ

西暦20XX年、小学5年生の光熱斗は、特別な贈り物を受け取りました。それは、カスタムメイドのネットナビ、ロックマンです。ネットナビとは、パーソナルターミナル（PET）の中からオペレーターをサポートするAIプログラムのことです。ロックマンは小型で真面目な性格ですが、熱斗とはすぐに親友になります。

ネットバトルは、子供から大人まで人気のある娯楽で、自分のネットナビを仮想空間で戦わせ、腕を競い合います。熱斗とロックマンは、力を合わせて様々なサイバーテロに立ち向かい、デジタル世界と現実世界を脅かす陰謀を解き明かさなければなりません。