この青空に約束を― 〜ようこそつぐみ寮へ〜

ある朝、星野航は自分の部屋で見知らぬ少女が下着姿で眠っているのを見つける。少女、佐和木凛奈は目を覚ますと、航の顔を殴り、窓から飛び降りて逃げてしまう。その後、凛奈は航の学校に転校してくることになり、さらに航が住むつぐみ寮の新しいルームメイトとなる。

航は寮で他の4人の少女と先生と共に暮らしている。しかし、照水川重工が航空部門から撤退することになり、南佐古島の一大企業である同社の関係者は一年以内に島から避難しなければならなくなる。その結果、4人の少女も一年後には島を離れることになる。

凛奈は過去の経験から、別れの痛みを恐れ、航や他の少女たちと友達になることを拒む。しかし、航は彼女の考えに反対し、一年を通して、友情の素晴らしさを伝えようと努力する。