ストラトス・フォー

近未来の地球は、宇宙から飛来する隕石群の脅威にさらされていた。人類は惑星防衛のため、二段階の防衛システムを構築。第一段階は、宇宙ステーションに配備された彗星迎撃隊「コメットブラスター」。彼らは宇宙船から核弾頭ミサイルを発射し、大型隕石を宇宙空間で破壊する。そして、破壊しきれなかった隕石の破片は、第二段階として地上基地から発進する流星清掃隊「メテオスウィーパー」が、特殊ミサイルを搭載した超音速機で迎撃する。

下地島基地に所属するメテオスウィーパーの訓練生、本庄美風は、いつか憧れのコメットブラスターになることを夢見ている。ストラトス・フォーは、美風や仲間たちが厳しい訓練に挑み、様々な困難を乗り越えながら、一人前のパイロットを目指す姿を描く。常に宇宙からの脅威に晒されながら、彼女たちの青春が繰り広げられる。