ストラトス・フォー アドヴァンス

彗星迎撃隊（コメットブラスター）の試験で不可解な失敗を喫した美風たちは、下地島基地に帰還することになった。そこでは、新たに3人のメテオスイーパー訓練生を迎え、彼女たちは教官という立場に昇進する。

その間にも、地球に向けて新たな彗星が接近しており、宇宙危機管理機構（Cosmic Emergency Management Agency）内の亀裂、そして謎の宇宙生物（エイリアン・パラサイト）を巡る謎が解き明かされ始める。彗星と組織内の対立という二重の脅威に、美風たちは立ち向かうことになる。