この世の果てで恋を唄う少女YU-NO

歴史家である父親が最近失踪した少年、有馬拓也。夏休みに、拓也は行方不明の父親から奇妙な小包を受け取り、様々な並行世界の存在に関する情報が書かれた手紙が同封されていた。最初は疑っていた拓也だが、父親の主張を調査し始める。