Free!-Eternal Summer-

岩鳶高校水泳部創設から一年が経ちましたが、部員数は依然として伸び悩んでいます。七瀬遙と橘真琴が三年生になり、葉月渚と竜ヶ崎怜と共に、新入部員を獲得する方法を見つけなければなりません。もしそれができなければ、部員不足のため、水泳部は翌年には廃部となってしまいます。

卒業が近づくにつれ、三年生たちは将来の計画を立てる時期でもあります。プロのスイマーになるという夢に向かって突き進む鮫柄学園水泳部の新キャプテン、松岡凛とは異なり、遙と真琴はどのような道に進むべきか迷っています。

さらに、凛の旧友である山崎宗介が鮫柄学園に編入してきます。有望なスイマーとして注目される宗介の登場は、凛、遙、そして宗介の関係に緊張をもたらし、彼らの友情とそれぞれの目標を試すことになります。