戦慄のミラージュポケモン

謎めいたポケモンの科学者であるユング博士は、コンピューターデータを使ってカブトプスやアーマルドのような絶滅したポケモンを復活させる新しいミラージュシステムを開発した。オーキド博士、サトシとその仲間たちは、ユング博士の招待でミラージュマンションに現れ、機械の能力の実演を見学する。ユング博士のミラージュポケモンとサトシのバトルの最中、機械が暴走し、ミラージュプテラが急襲してユング博士を誘拐する。「ミラージュマスター」と名乗る男が現れ、ミラージュシステムを使えば弱点が全くないポケモンを作り出せると宣言する。サトシ、カスミ、オーキド博士は、狂人を止め、命からがら逃げ出そうと奮闘する。